Home Epigenetics HDAC Hämmare Sodium butyrate

endast för forskning

Sodium butyrate HDAC Hämmare

Kat.nr.: S1999

Sodium butyrate (NaB, Butanoic acid sodium salt), natriumsaltet av smörsyra, är en histondeacetylashämmare och binder kompetitivt till zinkställena för klass I och II histondeacetylaser (HDACs). Denna förening hämmar cellcykelprogression, främjar differentiering och inducerar apoptos och autophagy i flera typer av cancerceller.
Sodium butyrate HDAC Hämmare Chemical Structure

Kemisk struktur

Molekylvikt: 110.09

Hoppa till

Kvalitetskontroll (Quality Control)

Batch: Renhet: 100.00%
100.00

Cellodling, behandling & arbetskoncentration
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Cellinjer Analystyp Koncentration Inkubationstid Formulering Aktivitetsbeskrivning PMID
human K562 cells Proliferation assay 1 mM Antiproliferative activity against human K562 cells at 1 mM in presence of guanosine
human H1299 cells Function assay 7 days Inhibition of human USP1/UAF1 in human H1299 cells assessed as reduction in colony formation after 7 days, EC50=3 μM
human JEG3 cells Function assay Inhibition of aromatase in human JEG3 cells by scintillation spectrometry, IC50=0.0015 μM
Klicka för att visa mer experimentella data för cellinjer

Kemisk information, lagring & stabilitet (Chemical Information, Storage & Stability)

Molekylvikt 110.09 Formel

C4H7NaO2

 Lagring (från mottagningsdatumet)
CAS-nr 156-54-7 Ladda ner SDF Lagring av stamlösningar

Synonymer NaB, Butanoic acid sodium salt Smiles CCCC(=O)[O-].[Na+]

Löslighet (Solubility)

In vitro
Batch:

Water : 22 mg/mL

Ethanol : 8 mg/mL

DMSO : Insoluble
(Fuktkontaminerad DMSO kan minska lösligheten. Använd färk, vattenfri DMSO.)

Molaritetsräknare

Massa Koncentration Volym Molekylvikt
Utspädningsräknare Molekylviktsräknare

In vivo
Batch:

In vivo-formuleringsräknare (Klar lösning)

Steg 1: Ange information nedan (Rekommenderas: Ett extra djur för att ta hänsyn till förluster under experimentet)

mg/kg g μL

Steg 2: Ange in vivo-formuleringen (Detta är endast räknaren, inte formuleringen. Vänligen kontakta oss först om det inte finns någon in vivo-formulering i löslighetsavsnittet.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Beräkningsresultat:

Arbetskoncentration: mg/ml;

Metod för att bereda DMSO-stamlösning: mg substans förlöst i μL DMSO ( Stamlösningskoncentration mg/mL, Vänligen kontakta oss först om koncentrationen överskrider DMSO-lösligheten för denna batch av substansen. )

Metod för att bereda in vivo-formulering: Ta μL DMSO stamlösning, tillsätt sedanμL PEG300, blanda och klarna, tillsätt sedanμL Tween 80, blanda och klarna, tillsätt sedan μL ddH2O, blanda och klarna.

Metod för att bereda in vivo-formulering: Ta μL DMSO stamlösning, tillsätt sedan μL Majsolja, blanda och klarna.

Obs: 1. Se till att vätskan är klar innan du tillsätter nästa lösningsmedel.
2. Se till att tillsätta lösningsmedlet/lösningsmedlen i ordning. Du måste se till att lösningen som erhålls i föregående tillsats är en klar lösning innan du fortsätter att tillsätta nästa lösningsmedel. Fysiska metoder som vortex, ultraljud eller varmt vattenbad kan användas för att underlätta upplösningen.

Verkningsmekanism (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
Histone deacetylase
In vitro
Butyrate mediates growth inhibition of colonic cancer cells and thereby to elucidate the molecular link between a high-fiber diet and the arrest of colon carcinogenesis. This compound induces p21 mRNA expression in an immediate-early fashion, through transactivation of a promoter cis-element(s) located within 1.4 kb of the transcriptional start site, independent of p53 binding. Sodium butyrate, at physiological concentrations, induces apoptosis in 2 adenoma cell lines, RG/C2 and AA/Cl, and in the carcinoma cell line PC/JW/FI. It exerts potent effects on a variety of colonic mucosal functions such as inhibition of inflammation and carcinogenesis, reinforcing various components of the colonic defence barrier and decreasing oxidative stress. This chemical inhibits most HDAC except class III HDAC and class II HDAC6 and -10. It also is the most effective fatty acid in stimulating or repressing the expression of specific genes.
In vivo
Sodium butyrate significantly extends survival in a dose-dependent manner, improves body weight and motor performance, and delays the neuropathological sequelae in the R6/2 transgenic mouse model of Huntington's disease (HD). This compound also increases histone and specificity protein-1 acetylation and protects against 3-nitropropionic acid neurotoxicity.
Referenser
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12840228/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14561870/
  • [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/649576/

Applikationer (Applications)

Metoder Biomarkörer Bilder PMID
Western blot Cyclin D3 / CDK4 / CDK6 / CDK2 p15INK4b / p21Cip1 Phospho-H3 Ser10 / Acetyl-H3Lys9 / Acetyl-H3Lys14 / Dimethyl-H3
S1999-WB1
24280698
Immunofluorescence Acetyl-H3Lys9
S1999-IF1
24280698

Klinisk prövningsinformation (Clinical Trial Information)

(data från https://clinicaltrials.gov, uppdaterad den 2024-05-22)

NCT-nummer Rekrytering Tillstånd Sponsor/Samarbetspartners Startdatum Faser
NCT00800930 Completed
Shigellosis
International Centre for Diarrhoeal Disease Research Bangladesh|Swedish International Development Cooperation Agency (SIDA)|Karolinska Institutet
 January 2005 Phase 2