endast för forskning
Kat.nr.: S7174
Kemisk struktur
| Relaterade mål | PD-1/PD-L1 CXCR STING AhR Immunology & Inflammation related CD markers Interleukins Anti-infection Antioxidant COX |
|---|---|
| Övrigt SPHK Inhibitorer | PF-543 hydrochloride SKI II Defensamide (MHP) K6PC-5 SKI-V SKI-178 |
| Cellinjer | Analystyp | Koncentration | Inkubationstid | Formulering | Aktivitetsbeskrivning | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Sf9 | Function assay | Inhibition of human recombinant SphK2 expressed in Sf9 cells assessed as radiolabeled products using 10 uM sphingosine and 10 uM gamma[32P]ATP by liquid scintillation counting, Ki=9.8μM | 25643074 | |||
| Sf9 | Function assay | 2 hrs | Inhibition of recombinant human full-length N-terminal His-tagged SK2 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using NBD-Sph as substrate measured after 2 hrs by fluorescence based HPLC analysis, Ki=9.8μM | 30889352 | ||
| Klicka för att visa mer experimentella data för cellinjer | ||||||
| Molekylvikt | 380.91 | Formel | C23H25ClN2O |
Lagring (från mottagningsdatumet) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr | 915385-81-8 | Ladda ner SDF | Lagring av stamlösningar |
|
|
| Synonymer | N/A | Smiles | C1C2CC3(CC1CC(C2)(C3)C(=O)NCC4=CC=NC=C4)C5=CC=C(C=C5)Cl | ||
|
In vitro |
DMSO
: 76 mg/mL
(199.52 mM)
Ethanol : 28 mg/mL Water : Insoluble |
|
In vivo |
|||||
Steg 1: Ange information nedan (Rekommenderas: Ett extra djur för att ta hänsyn till förluster under experimentet)
Steg 2: Ange in vivo-formuleringen (Detta är endast räknaren, inte formuleringen. Vänligen kontakta oss först om det inte finns någon in vivo-formulering i löslighetsavsnittet.)
Beräkningsresultat:
Arbetskoncentration: mg/ml;
Metod för att bereda DMSO-stamlösning: mg substans förlöst i μL DMSO ( Stamlösningskoncentration mg/mL, Vänligen kontakta oss först om koncentrationen överskrider DMSO-lösligheten för denna batch av substansen. )
Metod för att bereda in vivo-formulering: Ta μL DMSO stamlösning, tillsätt sedanμL PEG300, blanda och klarna, tillsätt sedanμL Tween 80, blanda och klarna, tillsätt sedan μL ddH2O, blanda och klarna.
Metod för att bereda in vivo-formulering: Ta μL DMSO stamlösning, tillsätt sedan μL Majsolja, blanda och klarna.
Obs: 1. Se till att vätskan är klar innan du tillsätter nästa lösningsmedel.
2. Se till att tillsätta lösningsmedlet/lösningsmedlen i ordning. Du måste se till att lösningen som erhålls i föregående tillsats är en klar lösning innan du fortsätter att tillsätta nästa lösningsmedel. Fysiska metoder som vortex, ultraljud eller varmt vattenbad kan användas för att underlätta upplösningen.
| Targets/IC50/Ki |
SphK2
(Cell-free assay) 60 μM
|
|---|---|
| In vitro |
Opaganib (ABC294640) markedly alters the ratio of ceramide/S1P consistent with inhibition of SK activity in MDA-MB-231 cells. It inhibits tumor cell proliferation with IC50 values ranging from approximately 6 to 48 μM, and impairs tumor cell migration concomitant with loss of microfilaments. This compound induces nonapoptotic cell death, morphological changes in lysosomes, formation of autophagosomes, and increases in acidic vesicles in A-498, PC-3, and MDA-MB-231 cells. In both MCF-7 and ER-transfected HEK293 cells, it decreases E2-stimulated ERE-luciferase activity.
|
| Kinasanalys |
Sphingosine Kinase Assays
|
|
IC50-värdena för Opaganib (ABC294640) och DMS bestäms med en nyutvecklad HPLC-baserad SK-aktivitetsanalys. Kortfattat inkuberas testföreningarna med rekombinant SK1 eller SK2 och NBD-Sph i de isozymselektiva analysbuffertarna som beskrivs nedan med 1 mg/ml fettsyrafritt bovint serumalbumin, 100 μM ATP och 400 μM MgCl2. Produkten, dvs. NBD-S1P, separeras från NBD-Sph med HPLC på följande sätt: Waters 2795 HPLC-system med en Waters 2495 fluorescensdetektor, C8 Chromolith RP-8e-kolonn (100 × 4.6 mm), 1 ml/min mobilfas (acetonitril/20 mM natriumfosfatbuffert, pH 2.5, vid 45:55). Fluorescensen övervakas med excitation vid 465 nm och emission vid 531 nm. Förhållandet NBD-S1P/(NBD-Sph + NBD-S1P) används som ett mått på SK-aktivitet. SK-isozymselektiva analysbuffertar innehöll vardera 20 mM Tris, pH 7.4, 5 mM EDTA, 5 mM EGTA, 3 mM β-merkaptoetanol, 5% glycerol, 1× proteasinhibitorer och 1× fosfatasinhibitorer. För SK1-analysbufferten tillsätts 0.25% (slutlig) Triton X-100; och för SK2-bufferten tillsätts 1 M (slutlig) KCl. Analyserna körs i 2 timmar vid rumstemperatur, och sedan tillsätts 1.5 volym metanol för att avsluta kinasreaktionen. Efter 10 minuter centrifugeras proverna vid 20 000g för att pelletera det utfällda proteinet, och supernatanten analyseras med HPLC. I experiment för att bestämma Ki för hämning av SK2 av denna förening används ADP Quest-analyssystemet för att mäta kinasaktivitet i närvaro av varierande koncentrationer av sfingosin och det. För att bestämma effekterna av Opaganib på cellulär SK-aktivitet serum-svältes nästan konfluenta MDA-MB-231-celler över natten, och behandlades sedan med varierande koncentrationer av det. Cellerna inkuberades sedan med [3H]sfingosin vid en slutlig koncentration av 1 μM. Cellerna tar upp det exogena sfingosinet, som omvandlas till S1P via SK-aktivitet, och [3H]S1P separeras från [3H]sfingosin genom extraktion och kvantifieras genom scintillationsräkning.
|
|
| In vivo |
Opaganib (ABC294640) significantly reduces tumor growth in mice bearing mammary adenocarcinoma xenografts, associated with depletion of S1P levels. In severe combined immunodeficient mice bearing A-498 xenografts, it delays tumor growth and elevates autophagy markers. This compound also protects against liver transplantation-induced inflammation and cross-talk between innate and adaptive immunities, major events precipitating and exacerbating graft injury, and improves liver function and survival.
|
Referenser |
|
| Metoder | Biomarkörer | Bilder | PMID |
|---|---|---|---|
| Western blot | c-Myc pRb / Rb H3K9ac / p21 p-STAT3 / STAT3 |
|
27517489 |
| Growth inhibition assay | Cell proliferation |
|
25122609 |
(data från https://clinicaltrials.gov, uppdaterad den 2024-05-22)
| NCT-nummer | Rekrytering | Tillstånd | Sponsor/Samarbetspartners | Startdatum | Faser |
|---|---|---|---|---|---|
| NCT02939807 | Withdrawn | Carcinoma Hepatocellular |
Medical University of South Carolina|National Cancer Institute (NCI)|Apogee Biotechnology Corporation |
September 30 2019 | Phase 2 |
| NCT03377179 | Completed | Cholangiocarcinoma|Cholangiocarcinoma Non-resectable|Cholangiocarcinoma Perihilar|Cholangiocarcinoma Extrahepatic|Cholangiocarcinoma Intrahepatic |
RedHill Biopharma Limited |
March 7 2018 | Phase 2 |
| NCT02757326 | Terminated | Multiple Myeloma |
RedHill Biopharma Limited|Apogee Biotechnology Corporation|Duke University|National Cancer Institute (NCI) |
December 13 2016 | Phase 1|Phase 2 |
| NCT02229981 | Withdrawn | Diffuse Large B Cell Lymphoma|Kaposi Sarcoma |
RedHill Biopharma Limited|Louisiana State University Health Sciences Center in New Orleans|Apogee Biotechnology Corporation |
July 2014 | Phase 1|Phase 2 |
| NCT01488513 | Completed | Pancreatic Cancer|Unspecified Adult Solid Tumor Protocol Specific |
RedHill Biopharma Limited|Apogee Biotechnology Corporation|Medical University of South Carolina|FDA Office of Orphan Products Development|National Cancer Institute (NCI) |
August 2011 | Phase 1 |