endast för forskning

GSK-J4 Hydrochloride H3K27 histondemetylashämmare

Kat.nr.: S7070

GSK J4 HCl är ett cellpermeabelt prodrug av GSK J1, som är den första selektiva hämmaren av H3K27 histondemetylaserna JMJD3 och UTX med IC50 på 60 nM i en cellfri analys och inaktiv mot en panel av demetylaser av JMJ-familjen.
GSK-J4 Hydrochloride Histone Demethylase Hämmare Chemical Structure

Kemisk struktur

Molekylvikt: 453.96

Hoppa till

Kvalitetskontroll (Quality Control)

Batch: Renhet: 99.48%
99.48

Cellodling, behandling & arbetskoncentration
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Cellinjer Analystyp Koncentration Inkubationstid Formulering Aktivitetsbeskrivning PMID
CUTLL1 Growth inhibitory assay 2 μM DMSO affects cell growth 25132549
CUTLL1 Apoptosis assay 2 μM DMSO induces apoptosis 25132549
CUTLL1 Function assay 2 μM DMSO induces cell cycle arrest 25132549
CUTLL1 Kinase assay 6 μM DMSO leads to increased H3K27me3 25132549
SF7761 Kinase assay 6 μM DMSO increases K27 methylation 25401693
SF8628 Kinase assay 6 μM DMSO increases K28 methylation 25401693
H3.3 Kinase assay 6 μM DMSO increases K29 methylation 25401693
SF9012 Kinase assay 6 μM DMSO increases K30 methylation 25401693
SF9402 Kinase assay 6 μM DMSO increases K31 methylation 25401693
SF9427 Kinase assay 6 μM DMSO increases K32 methylation 25401693
human astrocytes Kinase assay 6 μM DMSO increases K33 methylation 25401693
SF7761 Growth inhibitory assay 6 μM DMSO inhibits K27M glioma cell growth 25401693
SF8628 Growth inhibitory assay 6 μM DMSO inhibits K28M glioma cell growth 25401693
H3.3 Growth inhibitory assay 6 μM DMSO inhibits K29M glioma cell growth 25401693
SF9012 Growth inhibitory assay 6 μM DMSO inhibits K30M glioma cell growth 25401693
SF9402 Growth inhibitory assay 6 μM DMSO inhibits K31M glioma cell growth 25401693
SF9427 Growth inhibitory assay 6 μM DMSO inhibits K32M glioma cell growth 25401693
human astrocytes Growth inhibitory assay 6 μM DMSO inhibits K33M glioma cell growth 25401693
TG neurons Function assay 50 μM DMSO inhibits HSV-1 reactivation from sensory neurons 25552720
Th17 Function assay 80 nM DMSO inhibits cell differentiation 25840993
β-cells Function assay 20 μM DMSO blunts IFNγ, Il-1β, and TNFα-induced chemokine gene expression 26505193
β-cells Function assay 20 μM DMSO induces β-cell dysfunction 26505193
ESCs Function assay 1.8 µM DMSO induces DNA damage along with activation of the DNA damage response 26759175
Raw 264.7 Function assay 0.8192 µM DMSO inhibits TNF-α production 26776360
MCF7 Function assay 1 to 10 uM 30 hrs Inhibition of KDM5A in human MCF7 cells assessed as effect on H3K4me3 methylation levels at 1 to 10 uM after 30 hrs by Western blot analysis 30392349
MCF7 Function assay 1 to 10 uM 30 hrs Inhibition of KDM5A in human MCF7 cells assessed as effect on H3K27me3 methylation levels at 1 to 10 uM after 30 hrs by Western blot analysis 30392349
RAW264.7 0.82 uM 24 hrs Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in mouse RAW264.7 cells 0.82 uM after 24 hrs by ELISA 26776360
RAW264.7 24 hrs Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in mouse RAW264.7 cells after 24 hrs by ELISA 26776360
Klicka för att visa mer experimentella data för cellinjer

Kemisk information, lagring & stabilitet (Chemical Information, Storage & Stability)

Molekylvikt 453.96 Formel

C24H27N5O2.HCl

Lagring (från mottagningsdatumet)
CAS-nr 1797983-09-5 Ladda ner SDF Lagring av stamlösningar

Löslighet (Solubility)

In vitro
Batch:

DMSO : 91 mg/mL (200.45 mM)
(Fuktkontaminerad DMSO kan minska lösligheten. Använd färk, vattenfri DMSO.)

Ethanol : 91 mg/mL

Water : 10 mg/mL

Molaritetsräknare

Massa Koncentration Volym Molekylvikt
Utspädningsräknare Molekylviktsräknare

In vivo
Batch:

In vivo-formuleringsräknare (Klar lösning)

Steg 1: Ange information nedan (Rekommenderas: Ett extra djur för att ta hänsyn till förluster under experimentet)

mg/kg g μL

Steg 2: Ange in vivo-formuleringen (Detta är endast räknaren, inte formuleringen. Vänligen kontakta oss först om det inte finns någon in vivo-formulering i löslighetsavsnittet.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Beräkningsresultat:

Arbetskoncentration: mg/ml;

Metod för att bereda DMSO-stamlösning: mg substans förlöst i μL DMSO ( Stamlösningskoncentration mg/mL, Vänligen kontakta oss först om koncentrationen överskrider DMSO-lösligheten för denna batch av substansen. )

Metod för att bereda in vivo-formulering: Ta μL DMSO stamlösning, tillsätt sedanμL PEG300, blanda och klarna, tillsätt sedanμL Tween 80, blanda och klarna, tillsätt sedan μL ddH2O, blanda och klarna.

Metod för att bereda in vivo-formulering: Ta μL DMSO stamlösning, tillsätt sedan μL Majsolja, blanda och klarna.

Obs: 1. Se till att vätskan är klar innan du tillsätter nästa lösningsmedel.
2. Se till att tillsätta lösningsmedlet/lösningsmedlen i ordning. Du måste se till att lösningen som erhålls i föregående tillsats är en klar lösning innan du fortsätter att tillsätta nästa lösningsmedel. Fysiska metoder som vortex, ultraljud eller varmt vattenbad kan användas för att underlätta upplösningen.

Verkningsmekanism (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
JMJD3
(Cell-free assay)
60 nM
In vitro

GSK J4 HCl is an ethyl ester derivative of the JMJD3 selective histone demethylase inhibitor GSK-J1 with an IC50 value greater than 50 μM in vitro. This compound is used to probe the consequences of demethylation of H3K27me3. In human primary macrophages, this chemical inhibits the lipopolysaccharide-induced production of cytokines, including pro-inflammatory tumour necrosis factor (TNF). In addition, it prevents the lipopolysaccharide-induced loss of H3K27me3 associated with the TNF transcription start sites and blocked the recruitment of RNA polymerase II.

Kinasanalys
Histone Demethylase AlphaScreen
Hämning av histondemetylaser bedöms med hjälp av histondemetylas AlphaScreen-analysen (Amplified Luminescence Proximity Homogenous Assay). Denna analys använder ett biotinylerat peptidsubstrat och bygger på detektering av produktens metylmärkning med hjälp av en specifik antikropp kopplad till protein-A-acceptorpärlor och en Steptavidin-donorpärla för att fånga upp peptiden. Kort sagt inkuberas rekombinanta demetylasenzymer i närvaro av Fe2+ i form av järnammoniumsulfat (FAS), α-ketoglutarat (KG) och biotinylerat peptidsubstrat. L-askorbinsyra ingår för att ge en reducerande miljö och förhindra oxidation av Fe2+. Efter inkubation med peptidsubstrat detekteras närvaron av produkten med hjälp av AlphaScreen-teknik. Demetylas AlphaScreen-analyserna utförs i 384-brunnsplattformat med vita proxiplattor. Alla steg utförs i analysbuffert (50 mM HEPES pH 7,5, 0,1 % (w/v) BSA och 0,01 % (v/v) Tween-20). FAS löses färskt varje dag i 20 mM HCl till en koncentration av 400 mM och späds till 1,0 mM i avjoniserat vatten. Alla andra komponenter löses färskt varje dag i avjoniserat vatten. För IC50-bestämningar överförs 5 μL analysbuffert innehållande demetylasenzym till brunnar i en 384-brunns proxiplatta. Titreringar av denna förening (0,1 μL) överförs till varje brunn och enzymerna får förinkuberas i 15 minuter med denna kemikalie (slutkoncentrationen av DMSO är 1 %). Enzymreaktionen initieras genom tillsats av 5 μL av en substratmix bestående av α-KG, FAS, L-askorbinsyra och biotinylerat peptidsubstrat och reaktionen inkuberas under angiven tid vid rumstemperatur. Enzymreaktionen stoppas efter angiven tid genom tillsats av 5 μL EDTA (7,5 mM slutkoncentration i analysbuffert). Streptavidin-donorpärlor (0,08 mg/ml) och Protein-A-konjugerade acceptorpärlor (0,08 mg/ml) förinkuberas i 1 timme med en antikropp mot produktens metylmärkning och närvaron av biotin-H3-produkt detekteras genom tillsats av 5 μL av de förinkuberade AlphaScreen-pärlorna (slutkoncentrationer på 0,02 mg/ml med avseende på acceptor- och donorpärlor). Detektering får fortgå i 1 timme vid rumstemperatur och analysplattorna avläses i en BMG Labtech Pherastar FS-plattläsare. Data normaliseras till kontrollen utan enzym och IC50 bestäms från den icke-linjära regressionskurvan med GraphPad Prism 5.
In vivo

GSK-J4 hydrochloride is a potent dual inhibitor of H3K27me3/me2-demethylases JMJD3/KDM6B and UTX/KDM6A. It inhibits LPS-induced TNF-α production in human primary macrophages. This compound is a cell permeable prodrug of GSK-J1.

Referenser