endast för forskning
Kat.nr.: S7070
Kemisk struktur
| Relaterade mål | HDAC JAK BET Histone Methyltransferase PKC PARP HIF PRMT EZH2 AMPK |
|---|---|
| Övrigt Histone Demethylase Inhibitorer | SP2509 JIB-04 GSK-LSD1 2HCl Iadademstat (ORY-1001) Dihydrochloride CPI-455 HCl OG-L002 IOX1 GSK J1 ML324 CP2 |
| Cellinjer | Analystyp | Koncentration | Inkubationstid | Formulering | Aktivitetsbeskrivning | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| CUTLL1 | Growth inhibitory assay | 2 μM | DMSO | affects cell growth | 25132549 | |
| CUTLL1 | Apoptosis assay | 2 μM | DMSO | induces apoptosis | 25132549 | |
| CUTLL1 | Function assay | 2 μM | DMSO | induces cell cycle arrest | 25132549 | |
| CUTLL1 | Kinase assay | 6 μM | DMSO | leads to increased H3K27me3 | 25132549 | |
| SF7761 | Kinase assay | 6 μM | DMSO | increases K27 methylation | 25401693 | |
| SF8628 | Kinase assay | 6 μM | DMSO | increases K28 methylation | 25401693 | |
| H3.3 | Kinase assay | 6 μM | DMSO | increases K29 methylation | 25401693 | |
| SF9012 | Kinase assay | 6 μM | DMSO | increases K30 methylation | 25401693 | |
| SF9402 | Kinase assay | 6 μM | DMSO | increases K31 methylation | 25401693 | |
| SF9427 | Kinase assay | 6 μM | DMSO | increases K32 methylation | 25401693 | |
| human astrocytes | Kinase assay | 6 μM | DMSO | increases K33 methylation | 25401693 | |
| SF7761 | Growth inhibitory assay | 6 μM | DMSO | inhibits K27M glioma cell growth | 25401693 | |
| SF8628 | Growth inhibitory assay | 6 μM | DMSO | inhibits K28M glioma cell growth | 25401693 | |
| H3.3 | Growth inhibitory assay | 6 μM | DMSO | inhibits K29M glioma cell growth | 25401693 | |
| SF9012 | Growth inhibitory assay | 6 μM | DMSO | inhibits K30M glioma cell growth | 25401693 | |
| SF9402 | Growth inhibitory assay | 6 μM | DMSO | inhibits K31M glioma cell growth | 25401693 | |
| SF9427 | Growth inhibitory assay | 6 μM | DMSO | inhibits K32M glioma cell growth | 25401693 | |
| human astrocytes | Growth inhibitory assay | 6 μM | DMSO | inhibits K33M glioma cell growth | 25401693 | |
| TG neurons | Function assay | 50 μM | DMSO | inhibits HSV-1 reactivation from sensory neurons | 25552720 | |
| Th17 | Function assay | 80 nM | DMSO | inhibits cell differentiation | 25840993 | |
| β-cells | Function assay | 20 μM | DMSO | blunts IFNγ, Il-1β, and TNFα-induced chemokine gene expression | 26505193 | |
| β-cells | Function assay | 20 μM | DMSO | induces β-cell dysfunction | 26505193 | |
| ESCs | Function assay | 1.8 µM | DMSO | induces DNA damage along with activation of the DNA damage response | 26759175 | |
| Raw 264.7 | Function assay | 0.8192 µM | DMSO | inhibits TNF-α production | 26776360 | |
| MCF7 | Function assay | 1 to 10 uM | 30 hrs | Inhibition of KDM5A in human MCF7 cells assessed as effect on H3K4me3 methylation levels at 1 to 10 uM after 30 hrs by Western blot analysis | 30392349 | |
| MCF7 | Function assay | 1 to 10 uM | 30 hrs | Inhibition of KDM5A in human MCF7 cells assessed as effect on H3K27me3 methylation levels at 1 to 10 uM after 30 hrs by Western blot analysis | 30392349 | |
| RAW264.7 | 0.82 uM | 24 hrs | Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in mouse RAW264.7 cells 0.82 uM after 24 hrs by ELISA | 26776360 | ||
| RAW264.7 | 24 hrs | Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in mouse RAW264.7 cells after 24 hrs by ELISA | 26776360 | |||
| Klicka för att visa mer experimentella data för cellinjer | ||||||
| Molekylvikt | 453.96 | Formel | C24H27N5O2.HCl |
Lagring (från mottagningsdatumet) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr | 1797983-09-5 | Ladda ner SDF | Lagring av stamlösningar |
|
|
|
In vitro |
DMSO
: 91 mg/mL
(200.45 mM)
Ethanol : 91 mg/mL Water : 10 mg/mL |
|
In vivo |
|||||
Steg 1: Ange information nedan (Rekommenderas: Ett extra djur för att ta hänsyn till förluster under experimentet)
Steg 2: Ange in vivo-formuleringen (Detta är endast räknaren, inte formuleringen. Vänligen kontakta oss först om det inte finns någon in vivo-formulering i löslighetsavsnittet.)
Beräkningsresultat:
Arbetskoncentration: mg/ml;
Metod för att bereda DMSO-stamlösning: mg substans förlöst i μL DMSO ( Stamlösningskoncentration mg/mL, Vänligen kontakta oss först om koncentrationen överskrider DMSO-lösligheten för denna batch av substansen. )
Metod för att bereda in vivo-formulering: Ta μL DMSO stamlösning, tillsätt sedanμL PEG300, blanda och klarna, tillsätt sedanμL Tween 80, blanda och klarna, tillsätt sedan μL ddH2O, blanda och klarna.
Metod för att bereda in vivo-formulering: Ta μL DMSO stamlösning, tillsätt sedan μL Majsolja, blanda och klarna.
Obs: 1. Se till att vätskan är klar innan du tillsätter nästa lösningsmedel.
2. Se till att tillsätta lösningsmedlet/lösningsmedlen i ordning. Du måste se till att lösningen som erhålls i föregående tillsats är en klar lösning innan du fortsätter att tillsätta nästa lösningsmedel. Fysiska metoder som vortex, ultraljud eller varmt vattenbad kan användas för att underlätta upplösningen.
| Targets/IC50/Ki |
JMJD3
(Cell-free assay) 60 nM
|
|---|---|
| In vitro |
GSK J4 HCl is an ethyl ester derivative of the JMJD3 selective histone demethylase inhibitor GSK-J1 with an IC50 value greater than 50 μM in vitro. This compound is used to probe the consequences of demethylation of H3K27me3. In human primary macrophages, this chemical inhibits the lipopolysaccharide-induced production of cytokines, including pro-inflammatory tumour necrosis factor (TNF). In addition, it prevents the lipopolysaccharide-induced loss of H3K27me3 associated with the TNF transcription start sites and blocked the recruitment of RNA polymerase II. |
| Kinasanalys |
Histone Demethylase AlphaScreen
|
|
Hämning av histondemetylaser bedöms med hjälp av histondemetylas AlphaScreen-analysen (Amplified Luminescence Proximity Homogenous Assay). Denna analys använder ett biotinylerat peptidsubstrat och bygger på detektering av produktens metylmärkning med hjälp av en specifik antikropp kopplad till protein-A-acceptorpärlor och en Steptavidin-donorpärla för att fånga upp peptiden. Kort sagt inkuberas rekombinanta demetylasenzymer i närvaro av Fe2+ i form av järnammoniumsulfat (FAS), α-ketoglutarat (KG) och biotinylerat peptidsubstrat. L-askorbinsyra ingår för att ge en reducerande miljö och förhindra oxidation av Fe2+. Efter inkubation med peptidsubstrat detekteras närvaron av produkten med hjälp av AlphaScreen-teknik. Demetylas AlphaScreen-analyserna utförs i 384-brunnsplattformat med vita proxiplattor. Alla steg utförs i analysbuffert (50 mM HEPES pH 7,5, 0,1 % (w/v) BSA och 0,01 % (v/v) Tween-20). FAS löses färskt varje dag i 20 mM HCl till en koncentration av 400 mM och späds till 1,0 mM i avjoniserat vatten. Alla andra komponenter löses färskt varje dag i avjoniserat vatten. För IC50-bestämningar överförs 5 μL analysbuffert innehållande demetylasenzym till brunnar i en 384-brunns proxiplatta. Titreringar av denna förening (0,1 μL) överförs till varje brunn och enzymerna får förinkuberas i 15 minuter med denna kemikalie (slutkoncentrationen av DMSO är 1 %). Enzymreaktionen initieras genom tillsats av 5 μL av en substratmix bestående av α-KG, FAS, L-askorbinsyra och biotinylerat peptidsubstrat och reaktionen inkuberas under angiven tid vid rumstemperatur. Enzymreaktionen stoppas efter angiven tid genom tillsats av 5 μL EDTA (7,5 mM slutkoncentration i analysbuffert). Streptavidin-donorpärlor (0,08 mg/ml) och Protein-A-konjugerade acceptorpärlor (0,08 mg/ml) förinkuberas i 1 timme med en antikropp mot produktens metylmärkning och närvaron av biotin-H3-produkt detekteras genom tillsats av 5 μL av de förinkuberade AlphaScreen-pärlorna (slutkoncentrationer på 0,02 mg/ml med avseende på acceptor- och donorpärlor). Detektering får fortgå i 1 timme vid rumstemperatur och analysplattorna avläses i en BMG Labtech Pherastar FS-plattläsare. Data normaliseras till kontrollen utan enzym och IC50 bestäms från den icke-linjära regressionskurvan med GraphPad Prism 5.
|
|
| In vivo |
GSK-J4 hydrochloride is a potent dual inhibitor of H3K27me3/me2-demethylases JMJD3/KDM6B and UTX/KDM6A. It inhibits LPS-induced TNF-α production in human primary macrophages. This compound is a cell permeable prodrug of GSK-J1. |
Referenser |
|