endast för forskning

LY3009120 Raf Hämmare

Kat.nr.: S7842

LY3009120 (DP-4978) är en potent pan-Raf-hämmare med IC50 på 44 nM, 31-47 nM och 42 nM för A-raf, B-Raf och C-Raf i A375-celler. Denna förening inducerar Autophagy. Fas 1.
LY3009120 Raf Hämmare Chemical Structure

Kemisk struktur

Molekylvikt: 424.51

Hoppa till

Kvalitetskontroll (Quality Control)

Batch: Renhet: 99.08%
99.08

Cellodling, behandling & arbetskoncentration
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Cellinjer Analystyp Koncentration Inkubationstid Formulering Aktivitetsbeskrivning PMID
A375 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human A375 cells after 72 hrs by resazurin assay, IC50=0.0092μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to EphA2 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.02μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to BRAF in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.031μM. 25965804
A375 Function assay 72 hrs Inhibition of BRAF V600E mutant in human A375 cells assessed as inhibition of ERK phosphorylation measured after 72 hrs by ELISA assay, IC50=0.037μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to ZAK in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.039μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to CRAF in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.042μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to ARAF in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.044μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to p38 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.061μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to FYN in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.091μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to MAP3K1 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.098μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to EphB4 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.1μM. 25965804
HCT116 Function assay Inhibition of KRAS G13D mutant in human HCT116 cells assessed as inhibition of ERK phosphorylation by ELISA, IC50=0.15μM. 25965804
A375 Function assay In vivo inhibition of BRAF V600E mutant in human A375 cells xenografted in po dosed NIH nude rat assessed as plasma concentration required to inhibit ERK phosphorylation by 50%, INH=0.165μM. 25965804
HCT116 Antiproliferative assay 67 hrs Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 67 hrs by resazurin assay, IC50=0.22μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to CSK in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.29μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to SRC in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.31μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to ABL in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.38μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to IRAK1 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.39μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to GCN2 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.45μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to JNK in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.47μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to MAP2K5 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.8μM. 25965804
A375 Function assay 15 mins Competitive binding affinity to KHS1 in human A375 cells after 15 mins in presence of ATP analogue, IC50=0.97μM. 25965804
HCT116 Function assay <100 nM Paradoxical activation of RAS/RAF/MEK signaling pathway in human HCT116 cells expressing wild type BRAF assessed as ERK phosphorylation at <100 nM 25965804
A375 Function assay Inhibition of desthiobiotin-ATP acylphosphate probe binding to B-Raf in human A375 cells by MS analysis, IC50=0.031μM. 30529543
A375 Function assay Inhibition of desthiobiotin-ATP acylphosphate probe binding to C-Raf in human A375 cells by MS analysis, IC50=0.042μM. 30529543
A375 Function assay Inhibition of desthiobiotin-ATP acylphosphate probe binding to A-Raf in human A375 cells by MS analysis, IC50=0.044μM. 30529543
MV4-11 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human MV4-11 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=0.1μM. 30529543
SK-MEL-2 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human SK-MEL-2 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=0.2μM. 30529543
A375 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human A375 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=0.3μM. 30529543
SW579 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human SW579 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=0.9μM. 30529543
HT-29 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human HT-29 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=0.9μM. 30529543
HepG2 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human HepG2 cells after 72 hrs by Cell-Titer Glo assay, IC50=2.6μM. 30529543
Klicka för att visa mer experimentella data för cellinjer

Kemisk information, lagring & stabilitet (Chemical Information, Storage & Stability)

Molekylvikt 424.51 Formel

C23H29FN6O

Lagring (från mottagningsdatumet)
CAS-nr 1454682-72-4 Ladda ner SDF Lagring av stamlösningar

Synonymer DP-4978 Smiles CC1=CC(=C(C=C1C2=C(N=C3C(=C2)C=NC(=N3)NC)C)NC(=O)NCCC(C)(C)C)F

Löslighet (Solubility)

In vitro
Batch:

DMSO : 20 mg/mL (47.11 mM)
(Fuktkontaminerad DMSO kan minska lösligheten. Använd färk, vattenfri DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molaritetsräknare

Massa Koncentration Volym Molekylvikt
Utspädningsräknare Molekylviktsräknare

In vivo
Batch:

In vivo-formuleringsräknare (Klar lösning)

Steg 1: Ange information nedan (Rekommenderas: Ett extra djur för att ta hänsyn till förluster under experimentet)

mg/kg g μL

Steg 2: Ange in vivo-formuleringen (Detta är endast räknaren, inte formuleringen. Vänligen kontakta oss först om det inte finns någon in vivo-formulering i löslighetsavsnittet.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Beräkningsresultat:

Arbetskoncentration: mg/ml;

Metod för att bereda DMSO-stamlösning: mg substans förlöst i μL DMSO ( Stamlösningskoncentration mg/mL, Vänligen kontakta oss först om koncentrationen överskrider DMSO-lösligheten för denna batch av substansen. )

Metod för att bereda in vivo-formulering: Ta μL DMSO stamlösning, tillsätt sedanμL PEG300, blanda och klarna, tillsätt sedanμL Tween 80, blanda och klarna, tillsätt sedan μL ddH2O, blanda och klarna.

Metod för att bereda in vivo-formulering: Ta μL DMSO stamlösning, tillsätt sedan μL Majsolja, blanda och klarna.

Obs: 1. Se till att vätskan är klar innan du tillsätter nästa lösningsmedel.
2. Se till att tillsätta lösningsmedlet/lösningsmedlen i ordning. Du måste se till att lösningen som erhålls i föregående tillsats är en klar lösning innan du fortsätter att tillsätta nästa lösningsmedel. Fysiska metoder som vortex, ultraljud eller varmt vattenbad kan användas för att underlätta upplösningen.

Verkningsmekanism (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
C-Raf
(Cell-free assay)
4.3 nM
BRAF(V600E)
(Cell-free assay)
5.8 nM
BRAF WT
(Cell-free assay)
15 nM
In vitro
LY3009120 inhibits the cell growth of A375 and HCT116 cells with the IC50 of 9.2 and 220 μM, respectively. This compound inhibits the tyrosine kinase KDR with the IC50 of 3.9 μM.
Kinasanalys
Mätning av kinasaktivitet med KiNativ-analyser
Föreningar screenas i A375-celllysat med användning av den ATP-baserade proben vid 5 µM. IC50-värden rapporteras i mikromolära enheter. Cellpellets resuspenderas i fyra volymer lysbuffert [25 mM Tris pH 7,6, 150 mM NaCl, 1 % CHAPS, 1 % Tergitol NP-40 typ, 1 % v/v fosfatas-hämmarcocktail II], sonikeras med en spets-sonikator och homogeniseras med dounce-homogenisator. Lysaten klaras genom centrifugering vid 100 000 g i 30 minuter. De klarade lysaten filtreras genom ett 0,22 μM sprutfilter och gelfiltreras in i reaktionsbuffert [20 mM Hepes pH 7,8, 150 mM NaCl, 0,1 % Triton X-100, 1 % v/v fosfatas-hämmarcocktail II]. MnCl2 tillsätts därefter till lysatet till en slutkoncentration på 20 mM före hämmarbehandling och probmärkning. Slutliga hämmarkoncentrationer som används för IC50-bestämningar är 10, 1, 0,1 och 0,01 μM. ATP-konkurrensförsök utförs vid 1 000, 100, 10 och 1 μM ATP. Alla hämmarbehandlingar utförs vid rumstemperatur.
In vivo
In rats bearing BRAF V600E ST019VR PDX tumors, LY3009120 (15 or 30 mg/kg, p.o.) shows a dose-dependent tumor growth inhibition. In nude rats bearing A375 xenograft, single dose oral treatment with this compound (3 to 50 mg/kg, p.o.) shows a dose dependent inhibition of phospho-ERK, with a dose for 50% inhibition of phospho-ERK (EC50) of 4.36 mg/kg, with plasma concentration to achieve 50% inhibition of phospho-ERK (EC50) of 68.9 ng/mL or 165 nM.
Referenser

Applikationer (Applications)

Metoder Biomarkörer Bilder PMID
Western blot Beclin-1 / Mcl-1 / LC3 / p62 p-EGFR / EGFR / p-BRAF / BRAF / p-CRAF / CRAF / p-MEK / MEK / p-AKT / AKT
S7842-WB2
28382170

Klinisk prövningsinformation (Clinical Trial Information)

(data från https://clinicaltrials.gov, uppdaterad den 2024-05-22)

NCT-nummer Rekrytering Tillstånd Sponsor/Samarbetspartners Startdatum Faser
NCT02014116 Terminated
Neoplasms|Neoplasm Metastasis|Melanoma|Carcinoma Non-Small-Cell Lung|Colorectal Neoplasms
Eli Lilly and Company
November 26 2013 Phase 1

Vanliga frågor (Frequently Asked Questions)

Fråga 1:
I am trying to figure out solubility of this compound for in vivo studies. I need some details on the formulation and how it is made to dissolve the chemical?

Svar:
It can dissolve in 4% DMSO/30% PEG 300/5% Tween 80/ddH2O at 1 mg/ml clearly, and in 0.5% CMC Na at 30 mg/ml as a suspension.